Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms