Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms