Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF2Q9Y6D5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF2Q9Y6D5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF2Q9Y6D5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF2Q9Y6D5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF2Q9Y6D5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF2Q9Y6D5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF2Q9Y6D5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms