Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms