Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms