Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms