Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1DQ9Y2S0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms