Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLEC11AQ9Y240 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms