Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms