Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms