Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms