Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms