Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF2Q9UG63 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms