Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms