Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD5Q9P267 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD5Q9P267 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms