Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms