Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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