Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms