Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms