Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms