Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms