Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPJQ9HC77 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms