Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AP000962.2-201ENST00000624971 1101 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms