Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms