Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms