Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms