Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms