Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCGF6Q9BYE7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms