Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms