Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK19Q9BWU1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK19Q9BWU1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK19Q9BWU1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK19Q9BWU1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK19Q9BWU1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK19Q9BWU1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK19Q9BWU1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK19Q9BWU1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK19Q9BWU1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK19Q9BWU1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms