Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms