Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms