Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA3CQ99985 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms