Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms