Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms