Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAMKK2Q96RR4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms