Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms