Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms