Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms