Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms