Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms