Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms