Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms