Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms