Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSR2Q969E8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR2Q969E8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms