Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TOPBP1Q92547 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOPBP1Q92547 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms