Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms