Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX54Q8TDD1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms