Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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