Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLGALT1Q8NBJ5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms